PRIMERCAT · 生命科学设计工具

引物猫:全自动生成可追溯的候选引物

转录本→Primer3→BLAST→评分
示意预览TP53 · NM_000546
5′ → 3′
ΔTm
0.3 °C
GC
55%
扩增子
152 bp
参考与验证记录2026-09-03

已归档的验证快照

以下为 2026-09-03 的参考数据与审计记录,并非实时服务状态。实际使用的数据库与筛查范围,请以每次设计结果的说明为准。

INDEX

索引范围

该快照记录了人类 4,514,782 条注释特征、202,461 条转录本—基因组定位,以及小鼠 3,023,953 条注释特征。

AUDIT

计算覆盖审计

我们公开的固定队列纳入 200 个基因、2,000 对候选;其中 1,648 对满足预设联合规则,180/200 个基因至少有一对通过。 查看审计记录

VERIFY

完整性与发布检查

我们核对了清单所列的 17/17 个人类运行文件,以及本次更新涉及的 3/3 个小鼠文件;跨主机 SHA-256 均一致。PrimerCat 软件基线通过 283 项后端测试,并完成 qPCR、PCR、CRISPR、BLAST 线上冒烟测试。

研究者不应把索引记录数解释为独立基因或可用候选数量,也不应把“通过”解释为湿实验成功率。

候选结果从哪里来

PrimerCat 为每个结果保留参考序列、设计约束、筛查范围和排序依据;研究者仍需在真实实验体系中确认其表现。

  1. 01

    确定参考序列

    PrimerCat 从 NCBI RefSeq 获取记录;人类基因优先采用 MANE Select,并保留 accession 与选择规则。[1][2]

  2. 02

    生成候选

    Primer3 按长度、Tm、GC%、产物区间和热力学阈值生成引物。[3]

  3. 03

    固定参考筛查

    PrimerCat 在可用的固定基因组和配套 RefSeq RNA 中模拟成对扩增,并显示数据库范围与命中上限。[4][5]

  4. 04

    排序与验证

    PrimerCat 用分数比较候选,但不把分数解释为成功率;研究者仍应按 MIQE 或相应框架完成实验验证。[6][7]

计算完成,不等于实验有效

PrimerCat 明确区分可复算数值、数据库筛查、启发式排序与实验确认。

COMPUTE

确定性计算

研究者可依据输入复算序列长度、GC%、坐标与配方换算。

SCREEN

数据库筛查

PrimerCat 的筛查结论只覆盖已声明的数据库、版本、阈值与命中上限。

RANK

启发式排序

PrimerCat 用分数帮助比较候选,但尚未在独立数据集上将其校准为成功概率。

VALIDATE

实验验证

研究者需要通过熔解曲线、凝胶、测序、效率曲线或细胞实验确认真实表现。